器质性病变是指有确切的病因和确切的部位发生疾病，比如胆囊结石、胆囊炎、胃炎、胃癌、阑尾炎以及肝脏发生病变，或者胰腺发生病变，这些疾病都是有固定的位置，以及有具体的病因而导致的。
如果是胆囊结石引起胆囊炎，当诊断明确以后，一般需要行手术切除，可以用腹腔镜胆囊切除手术，也可以用传统的胆囊切除手术，但现在多以微创手术为主。
如果是胃癌诊断明确以后，除非是晚期不能手术，其他的主要采用手术切除，并且行区域淋巴结清扫。
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