抗菌药物应该尽量的避免局部应用，因为皮肤粘膜局部应用抗菌药物以后很少被吸收，在感染的部位不能够达到有效浓度，反而容易引起过敏反应或者导致耐药菌的产生。
因此治疗全身性感染或者脏器感染的时候，应该全身用药，避免局部应用抗菌药物。抗菌药物的局部应用只限于少数情况，比如全身给药后在感染部位难以达到治疗浓度的时候，可以同时给予局部用药，比如中枢神经系统感染时某些药物可以鞘内给药，某些皮肤表层及口腔阴道等粘膜表面的感染也可以采用局部或者外用，但是局部用药的时候要采用刺激性小，不易导致耐药性和不易产生过敏反应的杀菌剂。
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