在临床当中，婴幼儿支原体感染的症状相对较重，可表现出喘息和呼吸困难，部分患儿可表现出肺外表现，如皮疹、溶血性贫血、心肌炎、冠脉栓塞、吉兰巴雷综合征等。
儿童支原体感染起病可缓可急，以发热和咳嗽为主要症状。
有些患儿发热时伴随畏寒、头痛、胸痛、胸闷等表现，伴随干咳、少数有粘痰、偶有痰中带血丝，此时咳嗽会逐渐加剧，个别化儿可表现出百日咳样痉挛性咳嗽。
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