怀孕时亲子鉴定方法有，怀孕期2-3个月，采集胎儿绒毛膜进行鉴定；怀孕期3.5-7个月，采集胎儿羊水进行鉴定。采集胎儿绒毛相对风险较大，致残致畸几率大，羊水鉴定相对安全。抽取羊水一定要去正规三甲以上等级的医院，以确保最大的安全保障。
做胎儿亲子鉴定，要同时准备母亲和父亲的样本，因为羊水含有母亲的成份，需同时做母亲的做对比。
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