福州大学硕士研究生的专业有应用经济学、数学、机械工程、材料科学与工程、电气工程、信息与通信工程等等。
福州大学于2005年开始筹建研究生院。目前，该校共有研究生8400余人，是福建省唯一的国家专业学位研究生教育综合改革试点大学和国家工程创新大学研究生教育。
2012年12月，福州大学研究生院正式成立，将为推进福州大学东南创业大学建设，在更高起点上推进学位和研究生教育搭建更广阔的平台。
学校现有全日制在校生近3万人，其中博士研究生近5000人，各类专业研究生2000多人。建校以来，为国家培养全日制硕士、本科毕业生10万余人。
这所大学是经中华人民共和国教育部批准招收外国和地区的港澳台地区本科生和研究生的大学。学校拥有2个国家级人才培养基地，3个国家级实验教学示范中心，320多个省内外校外实践教学基地。
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