大便不成形需明确病因后针对性治疗。
引起大便不成形的常见原因是溃疡性结肠炎和肠易激综合征，对于溃疡性结肠炎，可应用糖皮质激素或免疫抑制剂等药物控制炎症反应，若并发大出血、肠穿孔等经积极内科治疗无效的患者者，可行手术治疗；
对于肠易激综合征患者，若腹痛，可选用解痉药如抗胆碱类药物或调节内脏感觉的药物，若有腹泻症状，可根据病情适当选用止泻药。还可用肠道微生态制剂以纠正肠道菌群失调。
平时应加强锻炼，以增强机体免疫力，避免暴饮暴食，注意气候变化，避免受冷等刺激肠道引起功能失调。
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