沙门氏菌根据感染的类型不同，出现的症状也会不一样。最常见的是感染患有了肠炎，之后会出现腹痛、恶心、呕吐以及腹胀等表现。
如果是伤寒型，人体就会出现长期发热，伴胃肠道症状等。
志贺氏菌通称痢疾杆菌，主要有全身中毒症状与消化道症状。出现发热，乏力、食欲减退、恶心、呕吐、腹痛、腹泻、里急后重等症状，也有的出现中毒、休克。
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